Ny Bioinformatik Til Linux

Seal er en Python-modul, der giver sekvensalignment på Hadoop.Seal er en af ​​MapReduce ansøgning om biologisk sekvensalignment. Det kører på Hadoop (http://hadoop.apache.org) gennem Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), en Python MapReduce og HDFS API...

avalanchetoolbox er en værktøjskasse til at identificere og beskrive forgrening processer, såsom neuronale laviner Krav :. ...

Murka er et gratis, cross-platform og open source kommandolinje-software, der hjælper brugerne mulighed for nemt at løse Fylogeni problem, blot ved hjælp af Median Networks. Det omfatter heuristiske metoder, eksakte algoritmer, samt en Steiner...

. HTSeq er en Python ramme til at behandle og analysere data fra high-throughput sekventering (HTS) assays Krav : < li>...

Orange-Bioinformatik er en Orange data mining softwarepakke tilføjelse. & Nbsp; Det udvider Orange ved at give fælles funktionalitet til grundlæggende opgaver i bioinformatik. Det giver også widgets til Orange Canvas, som giver brugere, som ikke...

edittag er et program kollektion til design sæt edit metriske sekvensmærker, kontrol sekvensmærker for kropsbygning til redigeringen metriske, og integrere sekvensmærker til platform-specifikke sekventering adaptere og PCR-primere. edittag adskiller sig...

VULCAN Projektet giver Computational Fluid Dynamics analyse.VULCAN (Tyktflydende mod vindens retning algoritme til Complex flow analyse) giver Computational Fluid Dynamics til subsonisk hastighed gennem hypersonisk turbulent reagerer og ikke-reagerende...

seriesoftubes er en udvidet pipeline for Solexa chip seq data.Pakke Dokumentation Krav : ...

reciprocal_smallest_distance er en parvise orthology algoritme, der anvender globale sekvensalignment og maksimal sandsynlighed evolutionær afstand mellem sekvenser nøjagtigt registrerer ortologer mellem genomer. Installation fra et tar-arkiv Hent og...

Byg systemer som make ofte bruges til at skabe komplicerede arbejdsgange, f.eks i bioinformatik. & nbsp; snakemake har til formål at reducere kompleksiteten af ​​skabe arbejdsgange ved at give en ren og moderne domænespecifik specifikation sprog (DSL) i...