CLC Sequence Viewer

Software screenshot:
CLC Sequence Viewer
Software detaljer:
Version: 7.7.1 Opdateret
Upload dato: 1 Oct 16
Udvikler: CLC bio
Licens: Gratis
Popularitet: 288
Størrelse: 71872 Kb

Rating: nan/5 (Total Votes: 0)

CLC Sequence Viewer skaber en software miljø giver brugerne mulighed for at gøre et stort antal bioinformatik analyser, kombineret med glat datastyring, og fremragende grafisk visning og output muligheder.

Hvad er nyt i denne publicering:

Nye funktioner og forbedringer

  • Alle NCBI server kommunikation er nu krypteret. (NCBI vil flytte alle web services til HTTPS-protokollen 30. september 2016). & Nbsp;

  • Listen af ​​enzymer forudinstallerede i arbejdsbord & nbsp; er blevet opdateret fra Rebase.

  • Hurtig start værktøj er nu fundet under Toolbox menuen i stedet for menuen Vis og en knap kaldet Launch, der bringer op dette værktøj er blevet tilføjet til værktøjslinjen.

  • mulighed "er ikke i listen" er blevet indført som en ny tabel filtrering mulighed.
  • "Sort mappe" værktøj bruger nu numerisk sortering for filnavne præfikset et nummer.

  • Nye pladsholdere er tilgængelige, når der definerer navnene på eksportør udgange: & nbsp; {User}, & nbsp; {vært}, og for elementer af tidsstempel af produktionen objekt, {år}, & nbsp; {måned}, & nbsp; {dage}, & nbsp; {time, & nbsp; {minutter}, & nbsp; . {sekunder} & nbsp;
  • Pladsholdere inden eksport output navne, der tidligere var kun tilgængelig som cifre nu kan angives ved hjælp skriftlige navne: {input} er et synonym for {1}, {extension} er et synonym for {2} og {tæller} er et synonym for {3}.
  • GenBank import nu også mulighed for filnavne med 'GBFF "udvidelse.

  • Læs gruppe detaljer er nu vist på Element Info visning af sekvens lister.

Fejlrettelser
  • Rettet en sjælden fejl, hvor nogle anmærkninger kunne , men ikke nødvendigvis, gå mangler på & nbsp; sekvenser med mere end 1000 anmærkninger af en given type på denne sekvens før sletningen og hvor højreklik kontekst menupunktet "Slet markering" blev brugt. & nbsp;

  • Rettet en fejl i "Administrer enzymer" guide, der forhindrede en bruger fra at annullere handlingen, hvis "Bortset ny enzym liste" blev aktiveret.

  • Rettet et problem med Import Metadata værktøj, hvor, hvis et regneark allerede var blevet lastet og derefter vælge det samme regneark igen ikke genindlæse indholdet regneark.

  • Fixed et problem, hvor det tog lang tid at åbne en arbejdsbænk det var det & nbsp; previouslyclosed, når der vises en åben tabel editor, der var blevet sorteret. & nbsp;

  • Fixed et problem, hvor højreklikke på en graf i en rapport og vælge at vise "Report", "History" eller "Element Info" udløste en fejl.

  • Forskellige mindre fejlrettelser .

Hvad er nyt i version 7.7:

  • Alle Excel ark i et dokument bliver nu importeret og hvert ark har et bord skabt herfor.
  • CSV, HTML og Excel-tabel / tabelform eksportør nu bruge "Inf "og" NaN "værdier til at erstatte den tvetydige"? ".
  • i guiden for at eksportere en tabel i CSV-format, når de ikke eksporterer alle kolonner, er det nu muligt at annullere eller gå tilbage til den forrige trin, mens udvalgte kolonner lastning. & nbsp;
  • samme udskriftsindstillinger kan nu anvendes til flere rapporter i en enkelt eksportvare & nbsp;.
  • "Administrer Resources" fanen er blevet fjernet fra . den den Plugin manager

Hvad er nyt i version 7.6.1:

Fejlrettelser

  • Fixed et problem, hvor nogle filtrering operationer, såsom "indeholder ikke" ikke handlede korrekt ved filtrering tabelceller, der indeholdt flere stykker information.
  • Fast et problem, hvor anmærkninger, der strakte enderne af en cirkulær sekvens ville være forkert placeret i cirkulæret Sequence View.
  • Rettet en fejl, der forårsagede arbejdsbordet til at fryse, hvis visse sekvenser blev vist i cirkulære visning med radial gengivelse af etiketter.
  • Fixed et problem, hvor nogle filtrering operationer, såsom "indeholder ikke" ikke handle korrekt, når filtrering tabelceller, der indeholdt flere stykker information.
  • Fixed et problem som forhindrede en rod mappe på Windows kører i at blive brugt som en filplaceringen.
  • Fixed et problem, hvor opdatering af en eksisterende installation på Windows ville resultere i .vmoptions filen blive slettet, hvilket gør Workbench løb med . standard Java-konfiguration

Hvad er nyt i version 7.6:

Nye funktioner og forbedringer

  • En 3D Molecule Viewer er nu tilgængelig for visualisering af protein, RNA, DNA, og små molekyler.
  • Forbedret rapportering af fejl i forbindelse med lav diskplads.
Fejlrettelser
  • Rettet problem med links og tekst i tabeller, der blev skåret fra, når efterfølgende et link
  • Begrænsning websted analyse:. værdierne "Cut position (s) "kolonne i restriktionsstedet analyse bord nu opfører sig som tal i stedet for tekst, hvilket betyder sortering og filtrering værker.
  • Et problem med gemte tabel indstillinger, der undertiden ikke virkede er blevet rettet. Den bug fix indeholder en mere robust / generisk måde at spare borddækning med forskellige kolonner. For at løse dette problem, bør de eksisterende borddækning gemt først skal lastes på et objekt, hvor det virker (dvs. har samme kolonner som da den blev gemt); og derefter indstillinger bordet bør gemmes med det gamle navn for at overskrive indstillingerne & nbsp;

  • Metadata for fylogenetiske træer:. En fejl er blevet rettet & nbsp; med import af metadata indeholder kolonne navne med koloner.

  • Fast fejl, når viser protein oversættelser af anmærkninger kortere end 3 baser.

Hvad er nyt i version 7.5:.

  • De ubenyttede "Arbejdsprocesser" knappen er blevet fjernet fra værktøjslinjen
  • Lokal søgning aktiveret i menulinjen indeholder nu filtrering på "Path".
  • Avanceret filtrering på borde indeholder nu mulighed for at filtrere for et rum, komma eller semikolon afgrænsede lister over vilkår.
  • Zoom værktøjer redesign:. Zoom til valg funktion er nu også tilgængelig for sekvenser, sekvens lister, alignments, og læse tilknytninger
  • Lagring / anvende indstillinger side-panel for tabeller nu arbejder for forskellige tabeller, deler nogle kolonner. & nbsp;.
  • Kopier operationer kan nu stoppes

  • Importer fra eksempel data og import gøres gennem trække filer til arbejdsbord og slippe dem i Navigation-området vil ikke længere blokere brugergrænsefladen under udførelse. I stedet sker import som en baggrund proces, der kan overvåges og styres via fanen Processer i nederste venstre hjørne.

  • CLC arbejdsborde understøtter nu høj opløsning skærme som Apple nethinden skærme af alle data, der vises i View-området (herunder tooltips).
  • Mere informative navngivning af kodende region oversættelser produceret af værktøjet Oversæt til protein. Navnet på en kodende region oversættelse består af navnet på input sekvens efterfulgt af annotation type og endelig annotation navn.

Lignende software

IngredixX
IngredixX

3 Jan 15

What's My Place?
What's My Place?

4 Jan 15

MacPotthoff
MacPotthoff

3 Jan 15

Andre software developer CLC bio

Kommentarer til CLC Sequence Viewer

Kommentarer ikke fundet
Tilføj kommentar
Tænd billeder!