QMForge projekt kan bruges til at analysere resultaterne af kvantekemi (DFT) beregninger. Gauss 98/03, ADF, gamess (US), gamess (UK), PC-gamess, Jaguar, og ORCA filer understøttes (se nedenfor). De følgende analyser er tilgængelige:
· Mulliken Population Analyse (MPA)
· C-squared Population Analysis (SCPA)
· Overlapning Population Analysis (OPA)
· Mayers Bond Orders
· Oplad Nedbrydning Analysis (CDA)
· Fragment Analyse
MPA, CSPA, og OPA kræver et brugerdefineret sæt af fragmenter, og udskriver procent bidrag de fragmenter gør mod hinanden molekylær orbital i molekylet. Mayer obligationsudstedelser ordrer beregner obligations- ordrer mellem hvert par af atomer i molekylet. CDA og Fragment analyse kræver tre eller flere beregninger (en for hele molekylet, og to fragment beregninger), og give oplysninger om limning interaktioner mellem fragmenter.
QMForge er den direkte efterkommer af PyMOlyze, som var inspireret af konsollen-baseret, (oprindeligt) Windows-only program AOMix der har funktioner, herunder (og i tillæg til) de ovenfor nævnte. Jeg oprindeligt skrev PyMOlyze fordi jeg ønskede et brugervenligt (dvs.. Grafisk) Linux program til at gøre MPA for hver molekylær orbital af gaussiske beregninger. Jeg udvidede det til at håndtere filer fra geometri optimeringer, fordi jeg befandt mig ønsker jeg kunne oversætte og rotere den optimerede struktur og gemme det som en XYZ fil. Nu er det blevet omdøbt QMForge, og jeg bruger det til næsten alt undtagen gøre molekylære orbital billeder og diagrammer.
Der er stadig nogle analyser, som QMForge ikke gør, så hvis det ikke behandler dine behov, så tjek AOMix (eller skyde mig en e-mail, og vi vil tale).
QMForge er skabt ved hjælp af Python scripting sproget, Qt4 toolkit og dets python extensions PyQt4, numeriske, og cclib compuational pakke parsing bibliotek. Det er blevet testet på Windows XP, Windows 2000 og Mac OS X; det skal fungere lige så godt på en GNU / Linux-distribution, selvom jeg ikke har prøvet det endnu.
Hvad er nyt i denne version:
· Navneændring til QMForge
· ORCA support
· Skift til numpy 1.0.2 og openbabel 2.1.1
· Anvender cclib bygget fra 0,8 gren + unreleased ORCA parser
Kommentarer ikke fundet