GenoSuite er en ramme udviklet til proteogenomic analyse. FDRScore baseret strategi anvendes til at integrere resultater fra flere søgealgoritmer. Prokaryotisk Proteogenomic Tool (PPT) er udviklet som en del af GenoSuite rammer. PPT er til at finde nye oversættelser i prokaryote genomer og er afhængig af massespektrometri baseret proteomics data og relaterede genom sekvens. Funktioner omfatter konfigureret til 4 open source algoritmer til at udføre database søger efter identifikationspeptid og enhver kombination af de 4 algoritmen kan vælges, opregner de genom søgning specifikke peptider (nye peptider), kan spektrale kampe visualiseres for kvalitetsvurdering, lister ud de hidtil ukendte proteiner og ændringer i de eksisterende protein anmærkninger og en visuel genomisk forbindelse med de hidtil ukendte peptider kan også genereres.
Kommentarer ikke fundet