misopy

Software screenshot:
misopy
Software detaljer:
Version: 0.4.9
Upload dato: 20 Feb 15
Udvikler: Yarden Katz
Licens: Gratis
Popularitet: 7

Rating: nan/5 (Total Votes: 0)

MISO (Blanding af Isoformer) er en probabilistisk ramme skrevet i Python, der kvantificerer ekspressionsniveauet & nbsp; af alternativt splejsede gener fra RNA-Seq data, og identificerer differentielt regulerede isoformer eller exons tværs prøver.
Ved at modellere generative proces, hvor læser fremstilles af isoformer i RNA-Seq anvender MISO model Bayesiansk statistik til at beregne sandsynligheden for, at en read stammer fra en bestemt isoform.
MISO bruger udledte tildeling af læser for isoformer at kvantificere mængderne af den underliggende sæt af alternative mRNA-isoformer. Kan fås Konfidensintervaller end skøn, som kvantificere pålideligheden af ​​estimaterne.
Se http://genes.mit.edu/burgelab/miso/docs/ for MISO manual og dokumentation

Krav :.

  • Python

Lignende software

SyntenyMiner
SyntenyMiner

3 Jun 15

AREM
AREM

11 May 15

MetagenomeDB
MetagenomeDB

12 May 15

PEATDB
PEATDB

14 Apr 15

Kommentarer til misopy

Kommentarer ikke fundet
Tilføj kommentar
Tænd billeder!