Ny Bioinformatik Til Linux

Geant4 projekt er en værktøjskasse til simulering af passagen af ​​partikler gennem stof.Dens anvendelsesområder omfatter højenergifysik og nukleare eksperimenter, medicinske, speeder og rum fysik undersøgelser Hvad er nyt i denne udgivelse:. En...

STEME projektet startede livet som en tilnærmelse til forventningen-Maksimeringstest algoritme til den type model, der anvendes i motiv finderne som MEME.STEME & rsquo; s EM tilnærmelse kører en størrelsesorden hurtigere end meme gennemførelsen for...

Genepidgin er en suite af Python-værktøjer, som hjælper i evaluerings- og tildeling gen produktnavne & nbsp; Der er tre primære komponenter.:genepidgin * renere *& Nbsp; standardiserer gen navne pr UniProt navngivning retningslinjergenepidgin *...

capsid er en omfattende open source-platform, der integrerer en højtydende beregningsmæssige rørledning til identifikation & nbsp patogen sekvens; og karakterisering i menneskelige genomer og transcriptomes sammen med en skalerbar resultater database og...

MISO (Blanding af Isoformer) er en probabilistisk ramme skrevet i Python, der kvantificerer ekspressionsniveauet & nbsp; af alternativt splejsede gener fra RNA-Seq data, og identificerer differentielt regulerede isoformer eller exons tværs prøver.Ved at...

MACS2 er en model baseret analyseværktøj til chip-Seq data.Med forbedring af sekventeringsteknikker, kromatin immunofældning efterfulgt af high throughput sekventering (chip-Seq) bliver populært at studere genom-dækkende protein-DNA-interaktioner. For at...

Biotools er en flok bioinformatik forsyningsselskaber skrevet i Python Krav :. ...

PathVisio er et open source og helt gratis grafisk program implementeret i programmeringssproget Java og designet fra bunden til at blive brugt til visning, analyse og redigering biologiske veje under en GNU / Linux operativsystem system.Can bruges til at...

Pathomx (tidligere MetaPath) er en open source grafisk software implementeret i IPython, Qt og PyQt, designet fra bunden til at fungere som et interaktivt værktøj til visualisering og analyse af metaboliske data under GNU / Linux og andre POSIX & nbsp;...