kommandolinje værktøj til at sammenligne kommasepareret datafiler ved hjælp relative forskelle at fastlægge de mest lignende konformationer. Compsort sammenligner datafiler hjælp relative forskel, beregner en lighed score, sorterer scores i stigende rækkefølge (lavere værdier repræsenterer større lighed), sparer X antal lav score.
De datafiler produceret af brugeren, skal kommasepareret tekstfiler. Hver fil repræsenterer en unik molekyle. Hver række i en fil repræsenterer en unik konformation af molekylet. Den første kolonne i datafilen skal være unikt for kropsbygning repræsenteret ved rækken mærket. Resten af søjlerne er numeriske deskriptorer, såsom distance plads målinger.
Rækkerne sammenlignes kombinatorisk mellem filer. Etiketterne i sammenligning sammenkædes og gemmes med scoringer for sættet af rækker. Dette giver en måde at identificere de konformationer, der producerede en given lighed score.
Det fremtidige arbejde omfatter:
- tilføjer GUI interface
- udstationering papir på min 3D farmakofor modellering algoritme
- En parallel version ved hjælp MPI
Hvad er nyt i denne udgivelse:
- fast et par mindre compiler advarsler
- tilføjet rapportering af beregningstid for sæt af kombinatoriske beregninger ud over den tidligere rapporterede slags tid
- øget compiler optimering af den binære
Krav :
Mac OS X 10.3
Kommentarer ikke fundet