kommandolinje værktøj til at sammenligne kommasepareret datafiler ved hjælp relative forskelle at fastlægge de mest lignende konformationer. Compsortall sammenligner datafiler hjælp relative forskel, beregner en lighed score, sorterer scorer ud af kernen i stigende rækkefølge (lavere værdier repræsenterer større lighed), gemmer alle scoringer i en tekstfil. De datafiler produceret af brugeren, skal kommasepareret tekstfiler. Hver fil repræsenterer en unik molekyle. Hver række i en fil repræsenterer en unik konformation af molekylet. Den første kolonne i datafilen skal være unikt for kropsbygning repræsenteret ved rækken mærket. Resten af søjlerne er numeriske deskriptorer, såsom distance plads målinger. Rækkerne sammenlignes kombinatorisk mellem filer. Etiketterne i sammenligning sammenkædes og gemmes med scoringer for sættet af rækker. Dette giver en måde at identificere de konformationer, der producerede en given lighed score.
Det fremtidige arbejde omfatter:
tilføjer GUI interface
udstationering papir på min 3D farmakofor modellering algoritme
En parallel version ved hjælp MPI
Hvad er nyt i denne udgivelse:
- Ændret skærm udgang til sidste merge og skrive cyklus til mere præcist afspejler antallet af linjer sammen og skrevet.
- Fast stavefejl.
- små ændringer i kildekoden kommentering og variabelnavne at forbedre læsbarheden
Krav :.
Mac OS X 10.3
Kommentarer ikke fundet