GENESIS (forkortelse for General Neural Simulation System) er et generelt formål simulation platform, der blev udviklet for at understøtte simulering af neurale systemer spænder fra subcellulære komponenter og biokemiske reaktioner på komplekse modeller af enkelt neuroner, simuleringer af store netværk og Systems- level modeller.
GENESIS har dannet grundlag for laboratorie kurser i neural simulering på Caltech, Marinbiologisk Laboratorium, Kreta, Trieste, Bangalore og Obidos korte kurser i Computational Neuroscience, og mindst 49 universiteter, som vi har kendskab til.
De fleste nuværende GENESIS applikationer involverer realistiske simuleringer af biologiske neurale systemer. Selvom softwaren også kan modellere mere abstrakte netværk, andre simulatorer er mere egnet til backpropagation og lignende konnektionistisk modellering.
Installation
1. Vælg det sted, hvor du ønsker at installere "genesis" mappetræ. Hvis du vil lave en hele systemet installation som "root" brugeren, / usr / local er et godt valg. For en personlig installation, uden root-rettigheder, kan du bruge din hjemmemappe ("~"). Skift til denne mappe og udtrække genesis mappe fra arkivet fil genesis2.2.1-linux-bin.tar.gz. For eksempel
cd / usr / local
tar xvzf /mnt/cdrom/genesis2.2.1-linux-bin.tar.gz
eller uanset hvor du har det (f.eks ~ / downloads / genesis2.2.1-linux-bin.tar.gz).
2. Skift til "genesis" mappe og kør setup script, der skaber ".simrc" GENESIS initialisering fil ". Så kopiere .simrc til din hjemmemappe.
cd genesis
./binsetup
cp .simrc ~
3. finallly, tilsæt genesis mappe til din søgesti, således at "genesis" kan findes fra enhver mappe, som du er i. Hvis din login-shell er bash, kan du gøre dette ved at redigere .bashrc filen i din hjemmemappe at tilføje linjen
PATH = $ PATH: / usr / local / genesis
ved slutningen af filen. Hvis du bruger tcsh eller csh som din kommando shell, tilføj
sæt path = ($ path / usr / local / Genesis)
til din .tcsh eller .csh fil.
På dette tidspunkt, er du klar til at prøve at køre GENESIS. Skifte til den mappe Genesis / Scripts og prøve nogle af de tutorials foreslået i README-filen
Hvad er nyt i denne udgivelse:.
- Talrige fejlrettelser og forbedringer.
Kommentarer ikke fundet