KaKs Calculator

Kaks Calculator er en softwarepakke, der beregner ikke-synonyme og synonyme substitution satser gennem model udvælgelse og model gennemsnitsberegning. Da de nuværende metoder til denne estimering vedtager deres specifikke mutation modeller som anser forskellige evolutionære funktioner, hvilket fører til forskellige estimater, Kaks Calculator implementerer et sæt af kandidat modeller i en maksimal sandsynlighed ramme og vedtager Akaike information kriteriet for at måle fitness mellem modeller og data, der sigter at inkludere så mange funktioner som er nødvendig for nøjagtigt at indfange evolutionære information i protein-kodende sekvenser. Derudover er flere eksisterende metoder til beregning af Ka og Ks også medtaget i denne software.