MACS2

Software screenshot:
MACS2
Software detaljer:
Version: 2.0.10.20130731
Upload dato: 20 Feb 15
Udvikler: Tao Liu
Licens: Gratis
Popularitet: 71

Rating: 4.0/5 (Total Votes: 2)

MACS2 er en model baseret analyseværktøj til chip-Seq data.
Med forbedring af sekventeringsteknikker, kromatin immunofældning efterfulgt af high throughput sekventering (chip-Seq) bliver populært at studere genom-dækkende protein-DNA-interaktioner. For at afhjælpe manglen på kraftig chip-Seq analysemetode, præsenterer vi en ny algoritme, opkaldt Modelbaseret analyse af chip Seq (MACS), til identifikation afskrift faktor bindende sites. MACS fanger indflydelse genom kompleksitet at vurdere betydningen af ​​berigede chip regioner, og MACS forbedrer rumlige opløsning bindingssteder ved at kombinere oplysningerne om både sekventering tag placering og orientering. . MACS let kan anvendes til chip-Seq data alene, eller med kontrolprøve med stigningen af ​​specificitet

Krav :

  • Python

Lignende software

checkmyclones
checkmyclones

11 May 15

edittag
edittag

20 Feb 15

Genepidgin
Genepidgin

20 Feb 15

STEME
STEME

20 Feb 15

Kommentarer til MACS2

Kommentarer ikke fundet
Tilføj kommentar
Tænd billeder!