MultiGeneBlast er et open source værktøj baseret på en omformatering af FASTA overskrifter i NCBI GenBank protein poster, ved hjælp af hvilke det kan spore deres kilde nukleotid og koordinater. MultiGeneBlast kan støtte i afsløring af sådanne multigenfamilier dele til syntetisk biologi projekter. Der kan oprettes en syntetisk bibliotek af operoner baseret på dens udgang for at identificere de operoner, hvis funktion er tættest på den ene, som brugeren ønsker. Dette værktøj giver mulighed for at identificere alle homologe genomiske regioner ved at kombinere resultaterne af single BlastP kører på hvert gen, og sortering genomiske regioner fra enhver GenBank post med antallet af hits, synteny bevaring og kumulative Blast bit score. Arkitektur søgninger kan udføres for at finde nogen genomiske regioner med Blast hits til enhver brugerdefineret kombination af aminosyresekvenser.
Software detaljer:
Version: 1.1.5
Upload dato: 25 Jan 15
Licens: Gratis
Popularitet: 38
Størrelse: 14051 Kb
Kommentarer ikke fundet