PANAMA er en roman probabilistisk model til at redegøre for forstyrrende faktorer i eQTL undersøgelser, skrevet i Python.
Skjulte forstyrrende faktorer, såsom uobserverede kovariater eller ukendte subtile miljømæssige forstyrrelser kan skabe falske falske foreninger eller maskere reelle genetiske foreningens signaler. I modsætning til tidligere metoder, Panama lærer skjulte faktorer sammen med effekten af prominente genetiske regulatorer. Som et resultat heraf kan denne nye model mere præcist skelne ægte genetisk Association signaler fra confounding variation.
N. Fusi, O. Stegle og ND Lawrence, "Joint modellering af forstyrrende faktorer og fremtrædende genetiske regulatorer giver øget nøjagtighed i genetiske genomics studier", PLoS Computational Biology 2012
Flere informationer på http://ml.sheffield.ac.uk/qtl/panama.html
Requirements:
- Python
Kommentarer ikke fundet