LSim

LSim overlejres makromolekylære elektron tætheder og beregner en strukturel lighed score. Dens beregninger skalere lineært med størrelsen af ​​de molekyler, der sammenlignes.
De LSim alignments er begrebsmæssigt relateret til biokemiske strukturelle elementer, og derfor er saglig og passende for kun struktur-protein lighed studier.
Installation:
Pak distributionen fil:
tar -xzvf lsim-linux.tar.gz
Flyt til fil mappe:
cd lsim.1.0.0
Kopiere, flytte eller linke eksekverbare fil lsim til en passende placering -og sørg lsim er tilgængelig via PATH miljø variabelt, fx:
cp lsim / usr / local / bin
Sæt variabel LSIMDIR til at pege på den valgte LSim biblioteket, fx:
setenv LSIMDIR /home/olaguer/progs/lsim.1.0.0