Gratis Bioinformatik Til Linux

Seal er en Python-modul, der giver sekvensalignment på Hadoop.Seal er en af ​​MapReduce ansøgning om biologisk sekvensalignment. Det kører på Hadoop (http://hadoop.apache.org) gennem Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), en Python MapReduce og HDFS API...

TRMiner er en Python hjælpeprogram, der sigter mod videnskabelige data kuratorer. & Nbsp; Det gør det muligt hurtigt at beskære store samlinger af videnskabelige publikationer til sætninger er relevante for en given minedrift mål.Dette opnås i to trin....

Pysam er en Python-modul til læsning og manipulere Samfiles. & Nbsp; Det er en letvægts indpakning af samtools C-API.Den hurtig start guide er her. Mere detaljeret dokumentation er tilgængelig her.Spørgsmål og kommentarer er meget velkomne og bør sende...

PySCeS er et projekt udviklet af Triple-J Gruppen for Molecular Cell Physiology. & Nbsp; for at forsøge model og forstå de komplekse processer og systemer, der udgør den levende celle Egenskaber :. En tekstbaseret model beskrivelse sprog En...

kutling er en Python API til læsning binære datafiler oprettet ved hjælp af rammer datastyring Goby next-gen.Normalt denne mappe kommer som en del af den komplette Goby pakke, tilgængelig fra:& Nbsp; http: //goby.campagnelab.org/Den komplette pakke...

SSuMMo er et bibliotek med funktioner designet omkring iterativt ved hjælp HMMER at tildele sekvenser til taxa. & Nbsp; Resultaterne er yderst kommenterede træer med arter / slægten fordeling inden for dette samfund.Programmer inkluderet med kildekoden...

Burrows-Wheeler Aligner (BWA) er et effektivt program, der bringer relativt korte nukleotidsekvenser mod en lang referencesekvens såsom det humane genom.Softwaren implementerer to algoritmer, BWA-kort og BWA-SW. De tidligere værker for forespørgsel...

tørv en suite af programmer til at opfange, forudsige og analysere biofysiske karakteristika proteiner.Se http://enzyme.ucd.ie/PEAT for dokumentation, instruktioner, screenshots osv Krav :. ...

OpenElectrophy er en ramme for at lette håndtering, lagring og analyse af elektrofysiologiske data. Det kan importere data fra mange forskellige filformater og gemme dem i en enkelt SQL-typen database.Analyseværktøjer inkluderet i OpenELectrophy er...

NEO (Neural Ensemble Objects), og er et projekt, der skal give et fælles sæt af stamklasser, der skal anvendes i neural dataanalyse, med det formål at få OpenElectrophy, NeuroTools og måske andre projekter med lignende mål mere tæt sammen.To vigtige...