MISO (Blanding af Isoformer) er en probabilistisk ramme skrevet i Python, der kvantificerer ekspressionsniveauet & nbsp; af alternativt splejsede gener fra RNA-Seq data, og identificerer differentielt regulerede isoformer eller exons tværs prøver.
Ved at modellere generative proces, hvor læser fremstilles af isoformer i RNA-Seq anvender MISO model Bayesiansk statistik til at beregne sandsynligheden for, at en read stammer fra en bestemt isoform.
MISO bruger udledte tildeling af læser for isoformer at kvantificere mængderne af den underliggende sæt af alternative mRNA-isoformer. Kan fås Konfidensintervaller end skøn, som kvantificere pålideligheden af estimaterne.
Se http://genes.mit.edu/burgelab/miso/docs/ for MISO manual og dokumentation
Krav :.
- Python
Kommentarer ikke fundet