Visning protein-protein og ligand-protein interaktioner som grafer (netværk), hvor biomolekyler er repræsenteret som knudepunkter og deres samspil er repræsenteret som links, er en lovende metode til at integrere eksperimentelle resultater fra forskellige kilder for at opnå en systematisk forståelse af molekylære mekanismer kørsel cellefænotype. Fremkomsten af store signalering netværk giver mulighed for topologisk statistisk analyse, mens visualisering af sådanne netværk er en udfordring. SAVI implementerer standard metoder til at beregne klyngedannelse, tilslutningsmuligheder distribution og opdagelse, samt visualisering af netværk motiver. Derudover SAVI genererer en komplet hjemmeside fra nettet datasæt i tekstformat. SAVI indeholder et værktøj kaldet PathwayGenerator. Dette værktøj skaber forbindelse kort som websider fra store tabeller beskriver cellesignalering interaktioner. SAVI kan også oprette netværk fra lister over gen / protein navne
Version 2.5 kan omfatte uspecificeret opdateringer, forbedringer og bug fixes
Krav :..
Windows (alle)
Kommentarer ikke fundet