Serial Cloner

Serial Cloner er et molekylærbiologisk software. Det giver redskaber med en intuitiv brugerflade, der hjælper dig i DNA kloning, sekvensanalyse og visualisering. Serial Cloner er udviklet til at give en lys molekylærbiologi software til både Macintosh og Windows-brugere. Serial Cloner læser og skriver DNA Strider (tm) -kompatible filer og import og eksport filer i den universelle FASTA format (såvel som i pDRAW32 format). Kraftfulde grafiske display værktøjer og enkle grænseflader hjælpe analyse- og byggeri trin (adapter, PCR, Gateway [tm] kloning) i en meget intuitiv måde. Version 1.3 tilføjer nu en virtuel cutter, en webbrowser med øjeblikkelig import af NCBI / EMBL poster og en tavs restriktionskort sammen med andre forbedringer.

Hvad er nyt i denne udgivelse:

• [NEW] Skøn isoelektriske punkt proteinsekvenser (DNA og Protein Sequence vindue)
• [NEW] MacOSX version nu fordelt som en underskrevet ansøgning (Mountain Lion Gatekeeper kompatibilitet)
• [ADDED] en indstilling i Indstillinger for at vælge pK-værdi tabeller til brug for pI estimering
• [ADDED] en indstilling i Indstillinger for at bruge Codon kode fra kodonanvendelsen tabeller som en genetisk kode, der bruges til oversættelse
• [ADDED] En mulighed i Restriktionskortet vindue til kun oversætte nukleotider, der er i store bogstaver
• [ADDED] En knap / menu at vælge bestemte steder, der skal vises i Restriktionskort.
• [ADDED] Scan efter peptid Funktioner i proteinsekvenser
• [ADDED] Overtag funktioner, når reverse oversætte en DNA-sekvens
• [ADDED] En hurtig skifte mellem et DNA og protein Juster vindue
• [ADDED] Ikke formateret kopi af protein sekvens (Kopier mere ... Menu)
• [ADDED] Overtag funktioner, når kopiering / indsætning Proteinsekvenser
• [ADDED] Display Funktioner i Protein Juster (Local Align)
• [ADDED] En toggle knappen for at fremhæve forskelle i linie proteiner
• [ADDED] En genvej (S) til hurtigt at vise eller maske Features (på fanen Sequence Windows-funktioner)
• [ADDED] "Anchor" og "Core" domæner af primere er nu anerkendt som funktioner i Sequence Windows
• [ADDED] En knap for hurtigt at vælge en fuld lineær indsats i "Byg en konstruktion 'vindue
• [ADDED] Tilføjet en genvej til 'Kopiér Non Formateret "[Kommando-Skift-K]
• [ADDED] Et menupunkt for at gå til Serial Cloner Forum
• [ADDED] Et menupunkt for at gå til Serial Cloner Youtube Channel (tutorial)
• [OPDATERET] Det er nu muligt fuldt ud at ændre størrelsen Sequence vinduer
• [OPDATERET] Absent steder er angivet i kursiv i enzym til valg windows (Kort Grafisk og restriktioner)
• [OPDATERET] Unikke steder er angivet med fed skrift i enzym til valg windows (Kort Grafisk og restriktioner)
• [OPDATERET] parsing af NCBI sekvenser (Web Access) til at tage i hensyn til ændringer i NCBI sider.
• [OPDATERET] Forbedret parsing af sekvenser indeholdende 'X' i nukleotidsekvensen
• [OPDATERET] Ændret genvej af 'Kopier Alle sekvenser Multifasta' til [Kommando-Skift-J] i stedet for [Kommando-Skift-K]
• [RETTET] En Windows-specifik grænseflade bug den "Import Codon Bias 'vindue
• [RETTET] En fejl nogle gange forhindrer ordentlig kopi af billeder (Grafisk kort, Virtual Cut, shRNA) i udklipsholderen (Windows specifik)
• [RETTET] Et problem opstår med ualmindelige VE navne som R1.BceSIV i særlige enzym "Vælger på det grafiske kort.
• [RETTET] Et problem [Gateway Kloning] med funktioner indikation når destinationen vektor var antisense (ATT2-ATT1 retning)
• [RETTET] En fejl i udvælgelsen af ​​de mest anvendte AA når reverse oversætte
• [RETTET] Et problem med "Select All" i rækkefølge og Protein vinduer
• [RETTET] en filtype problem forbundet til Serial Cloner filer (bryde kompatibilitet med Sequencher import især)
• [RETTET] Ligering: Nogle gange unødigt produceret degenereret DNA
• [RETTET] Gateway: genererede DNA, men derefter når derefter gemmes som ukendt type
• [RETTET] PCR:. Hvis det gøres på "ukendt format" sekvens, forkert genereret "Protein" type
• [RETTET] Et problem opdatering funktion, når løsne en modifikation
• [RETTET] Hvis du indsætter et protein sekvens i GenBank format (NCBI) et protein sekvens vindue er nu korrekt oprettet.
• [RETTET] Et problem med NCBI BLAST serveren ved brug af ikke-ASCII-tegn i rækkefølge navne
• [RETTET] Et problem med Feature display efter en scanning, når kun én funktion blev fundet
• [RETTET] En sjælden problem med Feature skærm i konstruktionen Vindue
• [RETTET] En refresh problem ved brug af tegn størrelse forskellig fra 12 pt i grafisk kort.
• [RETTET] En fejl i Restriktionskortet vinduer, hvor den første linje i aminosyre oversættelse blev flyttet i codon-tilstand
• [RETTET] En fejl relateret forhindre, at tidligere valgte enzymer i den virtuelle Cutter Vindue