Sigint projekt er en kommando-linje software værktøj, der kan bruges til at finde og rangordne pattedyrsproteiner / gener, der specifikt og væsentligt interagerer med en liste over proteiner / gener i forbindelse med en baggrund pattedyr signalome og interactome netværk.
Input til programmet er: (a) en frø liste af humane Entrez Gene gen symboler, (b) en baggrund netværk i SIG-format, og (c) et navn for uddatafilen (web-side filnavn med htm udvidelse ). SIGINT udlæser en sorteret liste af gener / proteiner, der interagerer med komponenter fra listen frø. Disse komponenter er sorteret efter en z-score, der måler specificiteten af disse mellemliggende komponenter til at interagere med de gener / proteiner fra listen frø.
SIGINT kan køre på Linux, Mac og Windows-operativsystemer, og det kræver en baggrund netværk tekstfil i SIG-format.
Anvendelse:
Uddrag arkivet
chmod + x sigint_lnx.exe
./sigint_lnx.exe
Kommentarer ikke fundet