Spindelen er en alternativ fremgangsmåde til biologisk identifikation baseret på længden af ribosomalt RNA (rRNA) genregioner. Generelt opstillinger af primære rRNA-gen-sekvenser fra forskellige arter viser alternerende regioner af nucleotid bevarelse og variation, både hvad angår nukleotidsubstitutioner (almindeligvis kaldes "SNP'er") og insertion / deletion (InDel) begivenheder. Tilstedeværelsen af indels resulterer i sekvenser af forskellige længder og indfører huller i opstillingen, typisk betegnet med en streg "-".
Vores koncept for biologisk identifikation bruger rRNA gensekvenser som følger: konserverede regioner anvendes til at definere variable segmenter ("Spindel hypervariable regioner"), hvori en kombination af sekvens længder er karakteristisk for hver art (en "spindel profil"). Således kan hver art defineres ved en unik numerisk profil.
I teorien, en undersøgelse af blot 6 hypervariable regioner med 20 alleler hver (eller 11 regioner med 5 alleler hver) er nok til at diskriminere alle eukaryote arter på Jorden, som skønnes at være mellem 5 og 15 millioner i antal. I praksis Spindel er i stand til at skelne 93,3% af eukaryote arter med lav intraspecifikke variation og høj fylogenetiske opløsning.
For nylig viste Apps
Søg efter kategori
- Audio software
- Browsere
- Business & kontorsoftware
- CD og DVD software
- Desktop ekstraudstyr
- Digital foto software
- Disk & fil software
- Drivers
- Grafisk design software
- Hjem & familie software
- Internet software
- ITunes og iPod-software
- Kommunikationssoftware
- Netværkssoftware
- Produktivitet software
- Rejser & navigationssoftware
- Screensavers
- Sikkerhedssoftware
- Spil
- Systemværktøjer
- Uddannelsesmæssige og videnskab software
- Astronomi software
- E-bog software
- Enhed omformere
- Fremmedsprog software
- Fysik & kemi software
- Geografi software
- Matematik software
- Ordbøger og oversættere
- Pædagogiske værktøjer
- Religiøs software
- Skrive software
- Slægtsforskning software
- Studerende værktøjer
- Sundhed og fitness software
- Videnskab regnemaskiner
- Videnskab software
- Værktøjer til undervisere
- Mere pædagogisk og videnskab software
- Udviklingsværktøjer
- Underholdning og hobby software
- Video software
- Webudvikling software
Populære software
-
CYTSoft Psychrometric Chart 11 Jul 15
-
Linear Regression 11 Apr 18
-
Cross Section Analysis & Design 11 Apr 18
-
ChemLab 26 May 15
-
Optical Lenses 26 May 15
-
I-Doser Free 16 Apr 15
-
Solution Calculator 11 Apr 18
SPInDel workbench
Understøttede operativsystemer
Lignende software
TruthCounts in World Religion
6 May 15
KnotTheorist
11 Apr 15
UNITS32
7 Dec 15
Lunar Tracker
31 Dec 14
Kommentarer til SPInDel workbench
For nylig viste Apps
Søg efter kategori
- Audio software
- Browsere
- Business & kontorsoftware
- CD og DVD software
- Desktop ekstraudstyr
- Digital foto software
- Disk & fil software
- Drivers
- Grafisk design software
- Hjem & familie software
- Internet software
- ITunes og iPod-software
- Kommunikationssoftware
- Netværkssoftware
- Produktivitet software
- Rejser & navigationssoftware
- Screensavers
- Sikkerhedssoftware
- Spil
- Systemværktøjer
- Uddannelsesmæssige og videnskab software
- Astronomi software
- E-bog software
- Enhed omformere
- Fremmedsprog software
- Fysik & kemi software
- Geografi software
- Matematik software
- Ordbøger og oversættere
- Pædagogiske værktøjer
- Religiøs software
- Skrive software
- Slægtsforskning software
- Studerende værktøjer
- Sundhed og fitness software
- Videnskab regnemaskiner
- Videnskab software
- Værktøjer til undervisere
- Mere pædagogisk og videnskab software
- Udviklingsværktøjer
- Underholdning og hobby software
- Video software
- Webudvikling software
Populære software
-
Physics Simulations 21 Sep 15
-
Root Solver and Calculator 13 Apr 18
-
Dr. Regener Sun-Moon-Calendar 28 Apr 18
-
Shadows 7 Jan 15
-
Cross Section Analysis & Design 11 Apr 18
-
Texture AutoLookup (TAL) 3 Nov 15
-
Seq Format Converter 23 Jan 15
Kommentarer ikke fundet