Software detaljer:
bint er en software blev skrevet med det formål at opnå delmængder af intensitet data fra genotype assays. & Nbsp; Enten X & Y intensiteter for at skabe klynge plots eller log R Ratio og B allelfrekvenser for CNV detektion.
Ekstraktion af data for individuelle SNP / CNV markører eller individuelle prøver var langsom grep / awk'ing tekstfiler, der eksporteres fra genotype-run (f.eks Illumina endelige rapport filer).
Bint konverterer tekst repræsentation af intensitet float data til ind i en IEEE754 indekseret binær fil til hurtig ekstraktion af delmængder af dataene. I teorien kunne anvendes bint for eventuelle store tabeller af float data.
Kommentarer ikke fundet