CLC DNA Workbench

CLC DNA Workbench skaber en software miljø giver brugerne til at foretage en lang række avancerede DNA-sekvens analyse, kombineret med glat datastyring, og fremragende grafisk visning og output muligheder.
CLC DNA Workbench er tilgængelig på Windows, Mac OS X, og Linux-platforme

Funktioner :.

• Bioinformatik funktioner i Gene Workbench :
• Fleksibel visning af cirkulære molekyler.
• Editor for grafisk og algoritmisk avancerede primer design
• Montering af DNA sekvens data
• Molekylær kloning
• Automatisk SNP annotation af sekvenser
• Søg og opdagelsen af ​​DNA-mønstre
• Lokal kompleksitet region analyser
• Reverse oversættelse fra protein til gen, baseret på oversættelse tabeller fra en række arter
• Avanceret restriktionsenzymanalyse og ledelse
• Dot plot baserede analyser
• Short danner DNA statistik herunder en række karakteristika for en given molekyle
• NCBI sekvens datasøgning
• Adgang til web info fra PubMed
• Andre bioinformatiske funktioner:
• DNA, RNA og protein sekvens editor viser både lineære og cirkulære molekyler
• DNA, RNA og protein tilpasning editor
• Interaktive logoer langs begge DNA, RNA og protein alignments
• Batch behandling af analyser på flere sekvenser i et work-trin
• Motiv søgning
• Mønster opdagelse (ukendte mønstre)
• Avanceret re-tilpasning og fix-punkt justering option
• Sequence logo grafer langs DNA, RNA og protein alignments
• Manuel annotation af sekvenser
• Integreret PubMed søgninger
• Webbaseret sekvens søgning ved hjælp af BLAST
• Dot plot baserede analyser
• Lokal kompleksitet region analyser og kompleksitet plots
• Gap fraktion grafer
• G / C indholdsanalyse og grafer
• Projekt og datastyring:
• Fuld integration af data input, data management, beregningsresultater, og data eksport
• Detaljeret historie log
• Alle typer af filer kan gemmes i lokale projekter, og lancerede fra programmet
• Import og eksport af data i en lang række filformater
• Mulighed for at arbejde i flere aktive arbejdsområder ad gangen, gør det muligt samtidig arbejde på flere projekter
• Import af spor datafiler og kvalitet scoringer fra automatiserede DNA sequening maskiner, som anvender standard Chromatogram Format, ABI-formater og PHD-format (Phred)
• Visning og rapportering:
• Avanceret BLAST view
• Avancerede grafer se
• Avanceret histogram visning
• Avanceret dot plot visning
• Søg efter karakteristika i sekvenser og linjeføringer

Krav :

• 256 MB RAM kræves
• 512 MB RAM anbefales
• 1024 x 768 skærm anbefales

Begrænsninger :

• 4-ugers fuldt funktionel demo