BioPerl

BioPerl blev udviklet til at behandle biologisk data i Perl.
Det er et værktøj til at udforske Perl muligheder i bioinformatik verden

Hvad er nyt i denne udgivelse:.

• Major Windows Support opdateringer
• MAKER opdatering for at give mulighed for strengere standard codon tabel
• Bedre understøttelse for cirkulære sekvenser
• Rettelser til nogle komplekse lokationstyper
• Address contig fejl i GenBank format
• Deobfuscator rettelser

Hvad er nyt i version 1.6.922:.

• Address CPAN test fiaskoer
• Tilføjet Bioproject støtte til Genbank-filer.
• Bedre regex støtte til HMMER3 output.

Hvad er nyt i version 1.6.901:

• Anvendelse af AcePerl er forældet; Ace.pm er ikke aktivt vedligeholdt, og moduler, der bruger Ace vil også blive forældet.
• Minor bug fix release.
• Bio :: SeqIO :: gbxml test kræver XML :: SAX.
• Address Build.PL problemer, når DBI ikke er til stede.
• Skip gbxml.t og Interpro tester når moduler ikke installeret.
• Fjern forældede kode for perl 5.14.0 compat.
• På grund af skemaændringer og manglende støtte til ældre versioner, støtte til NeXML 0.9 er kun (meget) delvist gennemført.