Skal have Bioinformatik Til Linux
kutling er en Python API til læsning binære datafiler oprettet ved hjælp af rammer datastyring Goby next-gen.Normalt denne mappe kommer som en del af den komplette Goby pakke, tilgængelig fra:& Nbsp; http: //goby.campagnelab.org/Den komplette pakke...
. HTSeq er en Python ramme til at behandle og analysere data fra high-throughput sekventering (HTS) assays Krav : < li>...
Jmol er en open source, tværplatform og gratis grafisk software, der oprindeligt var designet til at fungere som molekylærviser til 3D kemiske strukturer. Den kører i fire standalone modes, som en HTML5 web app, et Java-program, en Java-applet og en...
LSim overlejres makromolekylære elektron tætheder og beregner en strukturel lighed score. Dens beregninger skalere lineært med størrelsen af de molekyler, der sammenlignes.De LSim alignments er begrebsmæssigt relateret til biokemiske strukturelle...
MacMolPlt er et moderne grafik program til plotte 3-D molekylære strukturer og normale tilstande (vibrationer). Moderne...
MACS2 er en model baseret analyseværktøj til chip-Seq data.Med forbedring af sekventeringsteknikker, kromatin immunofældning efterfulgt af high throughput sekventering (chip-Seq) bliver populært at studere genom-dækkende protein-DNA-interaktioner. For at...
massXpert massespektrometri pakke er en massespektrometri miljø for lineær (bio) polymerer. Det arver alle de nyskabelser i GNU polyxmass, da det er en havn i dette projekt til en cross-platform udviklingsmiljø Hvad er nyt i denne udgivelse:. ...
MetagenomeDB er en Python-bibliotek designet til nemt at gemme, hente og anmærke metagenomisk sekvenser. & Nbsp; MetagenomeDB fungere som en abstraktion lag oven på en MongoDB database. Det giver en API til at oprette og redigere og forbinde to typer af...
MISO (Blanding af Isoformer) er en probabilistisk ramme skrevet i Python, der kvantificerer ekspressionsniveauet & nbsp; af alternativt splejsede gener fra RNA-Seq data, og identificerer differentielt regulerede isoformer eller exons tværs prøver.Ved at...
mpiBLAST er en MPI baseret parallel gennemførelse af NCBI BLAST. Projektet består af et par programmer, som erstatter formatdb og blastall med versioner, der udfører BLAST jobs parallelt på en klynge af computere med MPI installeret. Der er to primære...
