Skal have Bioinformatik Til Linux
Staden Package er et fuldt udviklet sæt DNA-sekvens samling (Gap4), redigering og analyseværktøjer (Spin) for Unix, Linux, MacOSX og MS Windows.På Gap4 fronten har der været flere mindre sammenføjning relateredeforbedringer i hvordan det scorer joins Find...
STEME projektet startede livet som en tilnærmelse til forventningen-Maksimeringstest algoritme til den type model, der anvendes i motiv finderne som MEME.STEME & rsquo; s EM tilnærmelse kører en størrelsesorden hurtigere end meme gennemførelsen for...
SKRIDT er en pakke for nøjagtig stokastisk simulering af reaktion-diffusions systemer vilkårligt komplekse 3D geometrier. Vores kerne simulation algoritme er en implementering af Gillespie s SSA, udvidet til at beskæftige sig med diffusion af molekyler...
Syntainia er en innovativ applikation til visualisering af flere genomer. & Nbsp; Den præsenterer en enkel og intuitiv brugergrænseflade til at se og manipulere relationer mellem grupper af gener. Med en klarere gen visualisering, er det lettere for...
SyntenyMiner er et program til at visualisere og afhøre sammenligninger mellem flere komplette genom-sekvenser. Interfacet giver en sejlbar visning matches til en reference genomsekvens. Sekvens matcher mellem kromosomer fra forskellige genomer kan...
tapir er et Python værktøj, der indeholder programmer til at estimere og plot fylogenetiske meddelsomhed for store datasæt. Citerer tapir Ved brug af tapir, bedes citere:- Faircloth BC, Chang J, Alfaro ME: tapir giver high throughput analyse af...
tigreBrowser er en genekspression model browser til resultater fra tigre R-pakke (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html). Installation: tigreBrowser kræver Python version> = 2,5. tigreBrowser kan installeres med følgende...
TRMiner er en Python hjælpeprogram, der sigter mod videnskabelige data kuratorer. & Nbsp; Det gør det muligt hurtigt at beskære store samlinger af videnskabelige publikationer til sætninger er relevante for en given minedrift mål.Dette opnås i to trin....
VULCAN Projektet giver Computational Fluid Dynamics analyse.VULCAN (Tyktflydende mod vindens retning algoritme til Complex flow analyse) giver Computational Fluid Dynamics til subsonisk hastighed gennem hypersonisk turbulent reagerer og ikke-reagerende...