Skal have Bioinformatik Til Linux
ProteinShop er et interaktivt værktøj til at manipulere proteinstrukturer. Det var designet til hurtigt at skabe et sæt af protein konfigurationer ved hjælp af menneskelig viden og intuition. Disse konfigurationer kan blive udsat for lokal eller global...
pyNetConv er en Python bibliotek oprettet for at hjælpe omdannelsen af nogle netværk filformater.Siden version 0.6, pyNetConv er i stand til at læse / skrive (og konvertere fra / til) følgende...
Pysam er en Python-modul til læsning og manipulere Samfiles. & Nbsp; Det er en letvægts indpakning af samtools C-API.Den hurtig start guide er her. Mere detaljeret dokumentation er tilgængelig her.Spørgsmål og kommentarer er meget velkomne og bør sende...
PySCeS er et projekt udviklet af Triple-J Gruppen for Molecular Cell Physiology. & Nbsp; for at forsøge model og forstå de komplekse processer og systemer, der udgør den levende celle Egenskaber :. En tekstbaseret model beskrivelse sprog En...
reciprocal_smallest_distance er en parvise orthology algoritme, der anvender globale sekvensalignment og maksimal sandsynlighed evolutionær afstand mellem sekvenser nøjagtigt registrerer ortologer mellem genomer. Installation fra et tar-arkiv Hent og...
RFLP planner er et værktøj, der hjælper til at planlægge en RFLP eksperiment: Den finder restriktionsenzymer, der skærer et sæt af homologe DNA-sekvenser på forskellige måder, og simulerer den resulterende gel-elektroforese billede. Programmet hjælper dig...
Seal er en Python-modul, der giver sekvensalignment på Hadoop.Seal er en af MapReduce ansøgning om biologisk sekvensalignment. Det kører på Hadoop (http://hadoop.apache.org) gennem Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), en Python MapReduce og HDFS API...
seriesoftubes er en udvidet pipeline for Solexa chip seq data.Pakke Dokumentation
Krav :
...
Byg systemer som make ofte bruges til at skabe komplicerede arbejdsgange, f.eks i bioinformatik. & nbsp; snakemake har til formål at reducere kompleksiteten af skabe arbejdsgange ved at give en ren og moderne domænespecifik specifikation sprog (DSL) i...
SSuMMo er et bibliotek med funktioner designet omkring iterativt ved hjælp HMMER at tildele sekvenser til taxa. & Nbsp; Resultaterne er yderst kommenterede træer med arter / slægten fordeling inden for dette samfund.Programmer inkluderet med kildekoden...
