Ny Bioinformatik Til Linux
SKRIDT er en pakke for nøjagtig stokastisk simulering af reaktion-diffusions systemer vilkårligt komplekse 3D geometrier. Vores kerne simulation algoritme er en implementering af Gillespie s SSA, udvidet til at beskæftige sig med diffusion af molekyler...
NEO (Neural Ensemble Objects), og er et projekt, der skal give et fælles sæt af stamklasser, der skal anvendes i neural dataanalyse, med det formål at få OpenElectrophy, NeuroTools og måske andre projekter med lignende mål mere tæt sammen.To vigtige...
OpenElectrophy er en ramme for at lette håndtering, lagring og analyse af elektrofysiologiske data. Det kan importere data fra mange forskellige filformater og gemme dem i en enkelt SQL-typen database.Analyseværktøjer inkluderet i OpenELectrophy er...
tørv en suite af programmer til at opfange, forudsige og analysere biofysiske karakteristika proteiner.Se http://enzyme.ucd.ie/PEAT for dokumentation, instruktioner, screenshots osv Krav :. ...
Burrows-Wheeler Aligner (BWA) er et effektivt program, der bringer relativt korte nukleotidsekvenser mod en lang referencesekvens såsom det humane genom.Softwaren implementerer to algoritmer, BWA-kort og BWA-SW. De tidligere værker for forespørgsel...
SSuMMo er et bibliotek med funktioner designet omkring iterativt ved hjælp HMMER at tildele sekvenser til taxa. & Nbsp; Resultaterne er yderst kommenterede træer med arter / slægten fordeling inden for dette samfund.Programmer inkluderet med kildekoden...
kutling er en Python API til læsning binære datafiler oprettet ved hjælp af rammer datastyring Goby next-gen.Normalt denne mappe kommer som en del af den komplette Goby pakke, tilgængelig fra:& Nbsp; http: //goby.campagnelab.org/Den komplette pakke...
PySCeS er et projekt udviklet af Triple-J Gruppen for Molecular Cell Physiology. & Nbsp; for at forsøge model og forstå de komplekse processer og systemer, der udgør den levende celle Egenskaber :. En tekstbaseret model beskrivelse sprog En...
Pysam er en Python-modul til læsning og manipulere Samfiles. & Nbsp; Det er en letvægts indpakning af samtools C-API.Den hurtig start guide er her. Mere detaljeret dokumentation er tilgængelig her.Spørgsmål og kommentarer er meget velkomne og bør sende...
TRMiner er en Python hjælpeprogram, der sigter mod videnskabelige data kuratorer. & Nbsp; Det gør det muligt hurtigt at beskære store samlinger af videnskabelige publikationer til sætninger er relevante for en given minedrift mål.Dette opnås i to trin....
