Bedst Bioinformatik Til Linux

Byg systemer som make ofte bruges til at skabe komplicerede arbejdsgange, f.eks i bioinformatik. & nbsp; snakemake har til formål at reducere kompleksiteten af ​​skabe arbejdsgange ved at give en ren og moderne domænespecifik specifikation sprog (DSL) i...

CLC DNA Workbench skaber en software miljø giver brugerne til at foretage en lang række avancerede DNA-sekvens analyse, kombineret med glat datastyring, og fremragende grafisk visning og output muligheder.CLC DNA Workbench er tilgængelig på Windows, Mac...

seriesoftubes er en udvidet pipeline for Solexa chip seq data.Pakke Dokumentation Krav : ...

STEME projektet startede livet som en tilnærmelse til forventningen-Maksimeringstest algoritme til den type model, der anvendes i motiv finderne som MEME.STEME & rsquo; s EM tilnærmelse kører en størrelsesorden hurtigere end meme gennemførelsen for...

Genepidgin er en suite af Python-værktøjer, som hjælper i evaluerings- og tildeling gen produktnavne & nbsp; Der er tre primære komponenter.:genepidgin * renere *& Nbsp; standardiserer gen navne pr UniProt navngivning retningslinjergenepidgin *...

MISO (Blanding af Isoformer) er en probabilistisk ramme skrevet i Python, der kvantificerer ekspressionsniveauet & nbsp; af alternativt splejsede gener fra RNA-Seq data, og identificerer differentielt regulerede isoformer eller exons tværs prøver.Ved at...

Pathomx (tidligere MetaPath) er en open source grafisk software implementeret i IPython, Qt og PyQt, designet fra bunden til at fungere som et interaktivt værktøj til visualisering og analyse af metaboliske data under GNU / Linux og andre POSIX & nbsp;...

Burrows-Wheeler Aligner (BWA) er et effektivt program, der bringer relativt korte nukleotidsekvenser mod en lang referencesekvens såsom det humane genom.Softwaren implementerer to algoritmer, BWA-kort og BWA-SW. De tidligere værker for forespørgsel...

avalanchetoolbox er en værktøjskasse til at identificere og beskrive forgrening processer, såsom neuronale laviner Krav :. ...

OpenElectrophy er en ramme for at lette håndtering, lagring og analyse af elektrofysiologiske data. Det kan importere data fra mange forskellige filformater og gemme dem i en enkelt SQL-typen database.Analyseværktøjer inkluderet i OpenELectrophy er...