Bedst Bioinformatik Til Linux
MetagenomeDB er en Python-bibliotek designet til nemt at gemme, hente og anmærke metagenomisk sekvenser. & Nbsp; MetagenomeDB fungere som en abstraktion lag oven på en MongoDB database. Det giver en API til at oprette og redigere og forbinde to typer af...
SSuMMo er et bibliotek med funktioner designet omkring iterativt ved hjælp HMMER at tildele sekvenser til taxa. & Nbsp; Resultaterne er yderst kommenterede træer med arter / slægten fordeling inden for dette samfund.Programmer inkluderet med kildekoden...
tigreBrowser er en genekspression model browser til resultater fra tigre R-pakke (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html). Installation: tigreBrowser kræver Python version> = 2,5. tigreBrowser kan installeres med følgende...
MACS2 er en model baseret analyseværktøj til chip-Seq data.Med forbedring af sekventeringsteknikker, kromatin immunofældning efterfulgt af high throughput sekventering (chip-Seq) bliver populært at studere genom-dækkende protein-DNA-interaktioner. For at...
edittag er et program kollektion til design sæt edit metriske sekvensmærker, kontrol sekvensmærker for kropsbygning til redigeringen metriske, og integrere sekvensmærker til platform-specifikke sekventering adaptere og PCR-primere. edittag adskiller sig...
MacMolPlt er et moderne grafik program til plotte 3-D molekylære strukturer og normale tilstande (vibrationer). Moderne...
picme er en Python-pakke, der indeholder programmer til at estimere og plot fylogenetiske meddelsomhed for store datasæt. Installation For øjeblikket er den nemmeste måde at installere programmet er:git klon git: //github.com/faircloth-lab/picme.git / sti...
SyntenyMiner er et program til at visualisere og afhøre sammenligninger mellem flere komplette genom-sekvenser. Interfacet giver en sejlbar visning matches til en reference genomsekvens. Sekvens matcher mellem kromosomer fra forskellige genomer kan...
ProteinShop er et interaktivt værktøj til at manipulere proteinstrukturer. Det var designet til hurtigt at skabe et sæt af protein konfigurationer ved hjælp af menneskelig viden og intuition. Disse konfigurationer kan blive udsat for lokal eller global...
PySCeS er et projekt udviklet af Triple-J Gruppen for Molecular Cell Physiology. & Nbsp; for at forsøge model og forstå de komplekse processer og systemer, der udgør den levende celle Egenskaber :. En tekstbaseret model beskrivelse sprog En...
