Top Bioinformatik Til Linux

AHREA er en downloads pakke, der gør at finde Relativ Expression elever nemt. . Det er skrevet i Python Krav : ...

AREM er en baseret på MACS (Model Based Analyse for chip-Seq data).High-throughput sekventering koblet til chromatin immuno udfældning (chip-Seq) er almindeligt anvendt til at karakterisere hele genomet bindende mønstre af transkriptionsfaktorer,...

CWC Simulator er et C ++ implementering af CWC, en calculus for repræsentation og simulering af biologiske systemer. & Nbsp; Efter en vellykket installation (se INSTALL) vil du være i stand til at køre simulationer end CWC modeller, som vist i nogle...

Syntainia er en innovativ applikation til visualisering af flere genomer. & Nbsp; Den præsenterer en enkel og intuitiv brugergrænseflade til at se og manipulere relationer mellem grupper af gener. Med en klarere gen visualisering, er det lettere for...

checkmyclones er en software, der giver værktøjer til at kontrollere Sanger sekventering resultater. & Nbsp; (eller en almindelig tekst eller FASTQ-filer) mod et sæt af referencepunkter sekvenser, forudsat i enhver rimelig format (herunder koordinater) ...

tigreBrowser er en genekspression model browser til resultater fra tigre R-pakke (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html). Installation: tigreBrowser kræver Python version> = 2,5. tigreBrowser kan installeres med følgende...

picme er en Python-pakke, der indeholder programmer til at estimere og plot fylogenetiske meddelsomhed for store datasæt. Installation For øjeblikket er den nemmeste måde at installere programmet er:git klon git: //github.com/faircloth-lab/picme.git / sti...

tapir er et Python værktøj, der indeholder programmer til at estimere og plot fylogenetiske meddelsomhed for store datasæt. Citerer tapir Ved brug af tapir, bedes citere:- Faircloth BC, Chang J, Alfaro ME: tapir giver high throughput analyse af...

SKRIDT er en pakke for nøjagtig stokastisk simulering af reaktion-diffusions systemer vilkårligt komplekse 3D geometrier. Vores kerne simulation algoritme er en implementering af Gillespie s SSA, udvidet til at beskæftige sig med diffusion af molekyler...

NEO (Neural Ensemble Objects), og er et projekt, der skal give et fælles sæt af stamklasser, der skal anvendes i neural dataanalyse, med det formål at få OpenElectrophy, NeuroTools og måske andre projekter med lignende mål mere tæt sammen.To vigtige...